传统的普洱茶属于晒青称滇青茶，而黑茶在初加工过程中，有其特征性工艺渥堆。渥堆以微生物的代谢作用为主导，尽管普洱茶在毛茶晒青过程中也会有微生物参与，但两者所处的环境(温、湿度条件)不同，前者是促进有益微生物的生长和繁殖，而后者经过日晒，历时短，水分挥发迅速，相对而言却有了抑制微生物的活动。正因为如此，两者的毛茶品质特征显然不同，普洱茶原料晒青毛茶，青味重、汤味苦涩，而黑毛茶却无青味而代之以辛辣味，滋味醇和，苦涩味较轻，这是湖南黑茶新品与普洱新品生普的差异。
在后期储藏过程中，虽然都是以非酶性氧化和微生物作用作为品质变化的机制，但因为在毛茶加工过程中所形成的物质有质和量差异(两者机制不同)，其产物也就不同，这是湖南陈年黑茶区别于云南陈年生饼的关键所在。
1973年，普洱茶采用后发酵工艺，其发酵是在高温高湿的情况下进行的，与黑毛茶加工过程中的渥堆工艺有较大的差异。首先是反应基质的差异，普洱茶的反应基质是建立在晒青毛茶基础上的反应物，而黑茶则是杀青后的半成品作为反应物，两者不能混为一谈;其次，反应条件不同(温、湿度条件)，微生物的种群自然有一定的差异。
据湖南农大温琼英教授测定：普洱茶发酵过程中，微生物以黑曲酶为优势，而湖南黑茶却以假丝酵母菌为主。正因为这种差异，使茶叶本身的物质变化，代谢产物都有一定的区别。当然，如果普洱茶在低温低湿短时的条件下进行后发酵，其品质特征可能会更接近湖南黑茶。
此外，由于普洱茶与湖南黑茶在鲜叶原料方面的差异，亦是导致两者在茶汤浓度、色泽及耐泡性方面具有明显区别的原因之一。普洱茶原料是大叶种，其多酚类物质含量比中小叶种的湖南黑茶要高，因而茶汤浓度、茶汤色泽和耐泡性都较湖南黑茶要强。
综上所述，由于鲜叶原料、加工工艺及由此形成的物理化学变化机制的不同，导致了两种品质风格截然不同的茶品产生，两者各具特色，谁优谁劣，不可同言而喻。从品质风格上讲：普洱茶汤味浓厚，湖南黑茶甜纯爽口;普洱茶经久耐泡，湖南黑茶陈韵绵长(茶汤甘甜纯和，陈香突出持久)。
1、汤色差异
普洱茶汤色由青、靛青至栗红、深红、暗红，而湖南黑茶汤色由橙黄至橙红。
2、滋味差异
普洱茶入口茶味浓厚，湖南黑茶入口甘甜纯正。普洱茶经久耐泡，湖南黑茶陈韵隽长，尤以茶汤的甜纯。
3、香气差异
普洱茶香味相当复杂，因地域、工艺、存放地方、存放年代等因素的差异而呈现出不同的香气，整体感觉较丰富而厚重。湖南黑茶相对而言比较单纯。概括地说，普洱茶香气深沉，湖南黑茶则相对开阔、爽朗。
4、叶底差异
叶底特征取决于原料和加工工艺，云南普洱茶采摘的原料多属整个芽头，一芽二三叶，而且无需切碎，而湖南黑茶因有含梗要求，工艺上采用切碎工序，芽叶完整性较差(高档黑茶叶底完整性较好)。
5、功能差异
首先体现在茶性上，现代普洱熟茶及特别是存放多年的老茶，喝之有发热之感，而湖南黑茶则饮后青凉甜爽解渴。普洱茶对保护肠胃功能方面有独到之处，表现在对肠胃无刺激，久饮不伤胃。而湖南黑茶尤其是陈年黑茶则对肠胃病有独到的治疗效果。两者都有降血压和血脂的功效，可健美塑身，是可长期饮用的保健性饮料。另外，湖南黑茶在降血糖、治疗糖尿病方面功效较强。
